Webinar Hakkında
Sunucu
David Žihala
Özet
Çeşitli ökaryotların mitokondrileri standart genetik koddan farklı sapmalar geliştirmiştir, ancak olası değişikliklerin kapsamı ve filogenetik dağılımı yalnızca kısmen bilinmektedir. Dahası, daha önce dizilenmiş mitogenomlardaki bazı kodon yeniden atamalarının gözden kaçmış olması ve veri tabanlarında hatalı protein dizilerine yol açmış olması mümkündür. Mitogenom kodlu proteinlerdeki korunmuş amino asit konumlarında kodonların dağılımı incelendiğinde, yeşil alglerin Sphaeropleales takımının mitokondrileri, daha önce gözden kaçanlar ve bugüne dek incelenen hiçbir çeviri sisteminde görülmemiş olanlar dahil olmak üzere çeşitli kodon yeniden atamaları sergilemektedir; bu da mevcut çeviri tablolarının yeniden tanımlanmasını ve en az yedi yenisinin oluşturulmasını gerektirmiştir. Hydrodictyaceae’de UAG kodonunun anlamına dair önceki bir tartışmayı çözüyoruz: bu kodon hiç şüphesiz alanin kodlamaktadır. Ayrıca AGG’nin, kimi zaman AGA ile birlikte, çeşitli sphaeropleallerde arginin yerine alanin kodladığını gösteriyoruz. Yeni saptanan diğer değişiklikler arasında belirli türlerde AGG kodonunun Arg’den Met’e ve CGG kodonunun Arg’den Leu’ya yeniden atanması yer alıyor. Sphaeropleal mitogenomların belirlediği tRNA’ların analizi, önerilen yeniden atamalar için doğrudan destek ve moleküler temel sağlıyor. Ayrıca, mitokondriyal salıverme faktörü mtRF1a’da, Sphaeropleales’te sonlanma kodonlarının kullanımındaki değişikliklerle bağıntılı benzersiz mutasyonlara işaret ediyoruz: iki bağımsız dur’dan anlama UAG yeniden ataması, bazı Scenedesmaceae’de UGA’nın yeniden ortaya çıkışı ve grupta yaygın olan UCA’nın anlamdan dur’a yeniden atanması. Kodon kaybolması, Sphaeropleales’te mitokondriyal genetik kodun dinamik evriminin başlıca itici gücü gibi görünüyor.
Tarih: 28 Nisan, 2020 – 7:00 PM (GMT+3)
Dil: İngilizce